Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABBR1Q9UBS5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms