Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DKK3Q9UBP4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DKK3Q9UBP4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms