Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms