Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms