Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms