Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHRF1Q9P1Y6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHRF1Q9P1Y6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHRF1Q9P1Y6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms