Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP1Q9NZI2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP1Q9NZI2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms