Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTMR4Q9NYA4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms