Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDX43Q9NXZ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX43Q9NXZ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms