Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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