Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK13-1Q9NX77 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms