Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDL2Q9NX52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms