Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR3EQ9NVU0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms