Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL11Q9NVR0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms