Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DCAF13Q9NV06 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DCAF13Q9NV06 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms