Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRP7BPQ9NSQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms