Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFA4L2Q9NRX3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFA4L2Q9NRX3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms