Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GLB2Q9NR46 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GLB2Q9NR46 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms