Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31BQ9NQW1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms