Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASCL3Q9NQ33 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms