Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FANCFQ9NPI8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms