Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms