Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms