Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARFGAP3Q9NP61 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFGAP3Q9NP61 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms