Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM3Q9NNZ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRM3Q9NNZ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms