Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms