Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1BQ9H9Y6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1BQ9H9Y6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms