Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SENP3Q9H4L4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SENP3Q9H4L4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms