Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIL1Q9H173 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIL1Q9H173 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms