Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC22A4Q9H015 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms