Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX6-2Q9C056 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms