Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUS3Q9BZE2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUS3Q9BZE2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms