Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP4-3Q9BYR4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms