Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIFKQ9BYG3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms