Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTFDC1Q9BY42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RTFDC1Q9BY42 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms