Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG6Q9BXT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms