Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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