Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRIP3Q9BW71 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRIP3Q9BW71 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms