Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM43Q9BTV4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms