Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2AFJQ9BTM1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms