Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TINF2Q9BSI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TINF2Q9BSI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms