Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SIKE1Q9BRV8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms