Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TM2D3Q9BRN9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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