Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF8Q9BRL6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms