Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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