Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAF11Q99590 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms