Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms