Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAT1Q99536 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VAT1Q99536 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms