Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCF12Q99081 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCF12Q99081 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms