Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms